Der Stadthafen Šibenik, im Herzen von Šibenik gelegen, verfügt über zwei Hauptpiers für das Anlegen von Booten und Yachten. Die Obala Dr. Franje Tuđmana ist ein 230 Meter langer Pier aus Beton und Stein. Er wird zum Anlegen von Yachten und Booten genutzt, die täglich gechartert werden. Gat Krka ist ein 100 Meter langer Pier aus Beton und Stein, der zum Anlegen von Passagierschiffen, Yachten und anderen Booten dient. Er verfügt über Anschlüsse für Wasser und Strom. Für kleinere Boote sind die besten Liegeplätze entlang der Obala Dr. Franje Tuđmana, von der Kathedrale bis zum Gat Krka,
und entlang der Obala Hrvatske Mornarice, von der Kathedrale bis zur Bucht von Dolac. Der Gat Krka hat einen Liegeplatz für die Küstenschifffahrtslinie, während die Bucht von Dolac für Boote der Einheimischen genutzt wird. Der Hafen bietet Wasser aus Hydranten, eine Zapfsäule in der Nähe von Gat Krka und Annehmlichkeiten wie Hotels, Restaurants, Banken, Reisebüros und ein Postamt in der Nähe. Zu den Orientierungspunkten gehören ein Licht am Kopf von Gat Krka, das ein weißer Turm mit Säule und Galerie ist, die Festung Sv. Ana und die markante Kuppel der Kathedrale.